معاذ الفهد
19-12-2010, 12:46 AM
السلام عليكم
اود ان اخبر الساده الباحثين و المهتمين بمجال الفايروسات ان احدث تسميه للفايروسات مع سرد تارخي مفصل لها. راجيا ان تعم الفائده للجميع
في امان الله
التسمية الحديثة للفيروسات ومراحل تطورها
مقدمة تاريخيه:
• العالم ستانلي عام 1935م الاعتماد في تسمية الفيروسات النباتية في السابق على اسم النبات المعزول منه الفيروس والأعراض التي يسببها مثل فيروس تبرقش التبغ.
• العالم جونسون عام 1927م اقترح نظام تسمية الفيروسات النباتية ووضعها في مجاميع اعتمادا على الاسم الشائع للعائل المعزول منه الفيروس متبوعا برقم مثل فيروس التبغ -1و2 وهكذا...
• العالم سميث عام 1937م اقترح الاسم يجب أن يكون لاتيني متبوعا بالرقم....
• في عام 1968م اقترحا نظام الكربتوجرام... Harrison and Gibbs العالمان
• ومن ثم أسند الأمر إلى اللجنة التالية لتطوير نظام متفق عليه في تسمية وتصنيف الفيروسات.
• "International Committee on Taxonomy of Viruses" (ICTV) in 1973.اللجنة العالمية لتقسيم (تصنيف) الفيروسات
• ("International Committee on Nomenclature of Viruses" 1966) سابقا تسمى اللجنة العالمية لتسمية الفيروسات
موقع الـلجنة العالمية لتقسيم الفيروسات على الشبكة العنكبوتية.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/fr-index.htm
في عام 1995 تم تصنيف الفيروسات عامة إلى رتبة واحدة و71 عائلة و11 تحت عائلة و175 جنس بالإضافة إلى العديد من الأجناس التي لا تزال تحت البحث. وقد تم تسجيل اكثر من 4000 فيروس حتى الآن ولا يزال هذا الرقم في تزايد مضطرد.
In 1995, 1 order, 71 families, 11 subfamilies, and 175 genera, including many floating genera, are found, and more than 4000 member viruses are recorded.
بالإضافة إلى ذلك هناك مئات الفيروسات التي لم يتم تصنيفها ولا تزال تحت البحث لأن المعلومات المتوفرة عنها غير كافية لتصنيفها.
100s of unassigned viruses, because of lack of data!!!!.
Index to the Unassigned Viruses أمثلة على الفيروسات النباتية التي لم يتم تصنيفها بعد
Host Plant Viruses
Genome ssDNA
Species banana bunchy top virus فيروس انتفاخ القمة في الموز
Species coconut foliar decay virus
فيروس تعفن المجموع الخضري في جوز الهند
Genome dsDNA
Species cucumber vein yellowing virus فيروس اصفرار العروق الخيار
Genome dsRNA
Species tobacco stunt virus فيروس تقزم التبغ
Genome ssRNA
Species Garlic viruses A,B,C,D فيروسات الثوم أ و ب وج ود
Species grapevine fleck virus فيروس التبرقش الخفيف في العنب
Species maize white line mosaic virus فيروس موزاييك الخط الأبيض في الذرة
الفيروسات النباتية على الشبكة العنكبوتية (إنترنت)
Plant Viruses Online
Descriptions and Lists from the VIDE Database
Virus Identification Data Exchange (VIDE). 1980s تعريف الفيروسات النباتية وتبادل المعلومات http://image.fs.uidaho.edu/vide/refs.htm#descriptions
Brunt, A., Crabtree, K. and Gibbs, A. (1990). Viruses of Tropical Plants: Descriptions and Lists from the VIDE Database. 707 pp. C.A.B. International, U.K.
غالباً من الصعوبة أن يكون هناك تعريف مميز لكل فيروس لأن أسماء الفيروسات في العوائل و الأجناس وكذلك الأنواع قد تتشابه بعضها مع بعض وخاصة أن الاسم الشائع لا يدل تماماً على العائلة أو الجنس الذي ينتمي إليه الفيروس لذا فإن من مهام اللجنة العالمية لتصنيف الفيروسات هو إيجاد نظام مناسب يستخدم النظام الرقمي العشري المماثل للمستخدم في تسمية الإنزيمات.
مثال للتسمية الحديثة:
10. Bromoviridae اسم العائلة ورقمها
10.0.1. Alfamovirus المجموعة الأولى ورقمها
10.0.1.0.001 Alfalfa mosaic virus الفيروس الممثل للمجموعة الأولى ورقمه (فيروس تبرقش البرسيم)
10.0.2. Ilarvirus المجموعة الثانية ورقمها
10.0.2.01. Ilarvirus Subgroup 1 تحت المجموعة الثانية ورقمها
10.0.2.01.01 Tobacco streak virus الفيروس الممثل لتحت المجموعة الثانية ورقمه (فيروس تخطيط التبغ)
10.0.2.02. Ilarvirus Subgroup 2
10.0.2.02.01 Asparagus virus 2
10.0.2.02.02 Blueberry necrotic shock virus
10.0.2.02.03 citrus leaf rugose virus
10.0.2.02.04 citrus variegation virus
10.0.2.02.05 Elm mottle virus
10.0.2.02.06 Tulare apple mosaic virus
10.0.2.03. Ilarvirus Subgroup 3
10.0.2.03.01 Apple mosaic virus
10.0.2.03.02 Prunus necrotic ringspot virus
11. Bunyaviridae
11.0.U.01. Bhanja virus Group
11.0.U.02. Kaisodi virus Group
11.0.U.03. Mapputta virus Group
11.0.U.04. Okola virus Group 11.0.U.05. Resistencia virus Group 11.0.U.06. Upolu virus Group 11.0.U.07. Yogue virus Group 11.0.1. Bunyavirus
11.0.5. Tospovirus
11.0.5.0.001 Tomato spotted wilt virus
11.0.5.0.002 Impatiens necrotic spot virus
11.0.5.DE.01 Peanut yellow spot virus
11.0.5.T.DE.1 Groundnut ringspot virus
U : Unassigned yet. لم يتم اعتماده من اللجنة
DE: Not recognised by ICTV yet, listed in database of VIDEdB.لم يتم إقراره من اللجنة و إنما تم وضعه في قائمة قواعد المعلومات الخاصة بالفيروسات النباتية.
T : Tentative مقترح (مؤقت)
بدأ تصنيف الفيروسات عامة بتقسيمها إلى مجاميع على أساس تركيبها وخصائصها.ونظراً لازدياد الفيروسات التي تم التعرف عليها فقد استخدم نظام جديد لتقسيمها.
Family (العائلة)
تم التمييز بين العوائل باستخدام خصائص قياسية لشكل الفيروسات وخصائص الحمض النووي. ويعتبر الشكل الخارجي لجسيمة الفيروس هو الصفة الأساسية للتقسيم إلى عوائل.
Genus (الجنس)
تعتبر خصائص الحمض النووي هي الصفة الأساسية للتمييز بين أجناس الفيروسات.
Species (النوع)
يعتبر النوع طبقة لها مجموعة من الخصائص العامة التي لا يمكن الاعتماد على إحداها فقط للتمييز بين الأنواع المختلفة ولها صفات سلالية مشتركة يصعب معها التمييز بين الفيروسات في مثل هذه المجموعات ويوجد في نوع محدد من البيئات الحيوية ويقصد بها العوائل والأنسجة التي يوجد ويتكاثر (يكرر) بها الفيروس؟؟؟
العوائل و المجاميع الفيروسية النباتية هي:
• Alfamoviruses: Bromoviridae
• Alphacryptoviruses: Partitiviridae
• Badnaviruses
• Betacryptoviruses: Partitiviridae
• Bigeminiviruses: Geminiviridae
• Bromoviruses: Bromoviridae
• Bymoviruses: Potyviridae
• Capilloviruses
• Carlaviruses
• Carmoviruses: Tombusviridae
• Caulimoviruses
• Closteroviruses
• Comoviruses: Comoviridae
• Cucumoviruses: Bromoviridae
• Cytorhabdoviruses: Rhabdoviridae
• Dianthoviruses
• Enamoviruses
• Fabaviruses: Comoviridae
• Fijiviruses: Reoviridae
• Furoviruses
• Hordeiviruses
• Hybrigeminiviruses: Geminiviridae
• Idaeoviruses
• Ilarviruses: Bromoviridae
• Ipomoviruses: Potyviridae
• Luteoviruses
• Machlomoviruses
• Macluraviruses
• Marafiviruses
• Monogeminiviruses: Geminiviridae
• Nanaviruses
• Necroviruses
• Nepoviruses: Comoviridae
• Nucleorhabdoviruses: Rhabdoviridae
• Oryzaviruses: Reoviridae
• Ourmiaviruses
• Phytoreoviruses: Reoviridae
• Potexviruses
• Potyviruses: Potyviridae
• Rymoviruses: Potyviridae
• Satellite RNAs
• Satelliviruses
• Sequiviruses: Sequiviridae
• Sobemoviruses
• Tenuiviruses
• Tobamoviruses
• Tobraviruses
• Tombusviruses: Tombusviridae
• Tospoviruses: Bunyaviridae
• Trichoviruses
• Tymoviruses
• Umbraviruses
• Unassigned potyviruses: Potyviridae
• Unassigned rhabdoviruses: Rhabdoviridae
• Varicosaviruses
• Waikaviruses: Sequiviridae
• Ungrouped viruses
53 plant viral genera 53 جنساً (مجموعة)
10 Families 10 عوائل
اود ان اخبر الساده الباحثين و المهتمين بمجال الفايروسات ان احدث تسميه للفايروسات مع سرد تارخي مفصل لها. راجيا ان تعم الفائده للجميع
في امان الله
التسمية الحديثة للفيروسات ومراحل تطورها
مقدمة تاريخيه:
• العالم ستانلي عام 1935م الاعتماد في تسمية الفيروسات النباتية في السابق على اسم النبات المعزول منه الفيروس والأعراض التي يسببها مثل فيروس تبرقش التبغ.
• العالم جونسون عام 1927م اقترح نظام تسمية الفيروسات النباتية ووضعها في مجاميع اعتمادا على الاسم الشائع للعائل المعزول منه الفيروس متبوعا برقم مثل فيروس التبغ -1و2 وهكذا...
• العالم سميث عام 1937م اقترح الاسم يجب أن يكون لاتيني متبوعا بالرقم....
• في عام 1968م اقترحا نظام الكربتوجرام... Harrison and Gibbs العالمان
• ومن ثم أسند الأمر إلى اللجنة التالية لتطوير نظام متفق عليه في تسمية وتصنيف الفيروسات.
• "International Committee on Taxonomy of Viruses" (ICTV) in 1973.اللجنة العالمية لتقسيم (تصنيف) الفيروسات
• ("International Committee on Nomenclature of Viruses" 1966) سابقا تسمى اللجنة العالمية لتسمية الفيروسات
موقع الـلجنة العالمية لتقسيم الفيروسات على الشبكة العنكبوتية.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/fr-index.htm
في عام 1995 تم تصنيف الفيروسات عامة إلى رتبة واحدة و71 عائلة و11 تحت عائلة و175 جنس بالإضافة إلى العديد من الأجناس التي لا تزال تحت البحث. وقد تم تسجيل اكثر من 4000 فيروس حتى الآن ولا يزال هذا الرقم في تزايد مضطرد.
In 1995, 1 order, 71 families, 11 subfamilies, and 175 genera, including many floating genera, are found, and more than 4000 member viruses are recorded.
بالإضافة إلى ذلك هناك مئات الفيروسات التي لم يتم تصنيفها ولا تزال تحت البحث لأن المعلومات المتوفرة عنها غير كافية لتصنيفها.
100s of unassigned viruses, because of lack of data!!!!.
Index to the Unassigned Viruses أمثلة على الفيروسات النباتية التي لم يتم تصنيفها بعد
Host Plant Viruses
Genome ssDNA
Species banana bunchy top virus فيروس انتفاخ القمة في الموز
Species coconut foliar decay virus
فيروس تعفن المجموع الخضري في جوز الهند
Genome dsDNA
Species cucumber vein yellowing virus فيروس اصفرار العروق الخيار
Genome dsRNA
Species tobacco stunt virus فيروس تقزم التبغ
Genome ssRNA
Species Garlic viruses A,B,C,D فيروسات الثوم أ و ب وج ود
Species grapevine fleck virus فيروس التبرقش الخفيف في العنب
Species maize white line mosaic virus فيروس موزاييك الخط الأبيض في الذرة
الفيروسات النباتية على الشبكة العنكبوتية (إنترنت)
Plant Viruses Online
Descriptions and Lists from the VIDE Database
Virus Identification Data Exchange (VIDE). 1980s تعريف الفيروسات النباتية وتبادل المعلومات http://image.fs.uidaho.edu/vide/refs.htm#descriptions
Brunt, A., Crabtree, K. and Gibbs, A. (1990). Viruses of Tropical Plants: Descriptions and Lists from the VIDE Database. 707 pp. C.A.B. International, U.K.
غالباً من الصعوبة أن يكون هناك تعريف مميز لكل فيروس لأن أسماء الفيروسات في العوائل و الأجناس وكذلك الأنواع قد تتشابه بعضها مع بعض وخاصة أن الاسم الشائع لا يدل تماماً على العائلة أو الجنس الذي ينتمي إليه الفيروس لذا فإن من مهام اللجنة العالمية لتصنيف الفيروسات هو إيجاد نظام مناسب يستخدم النظام الرقمي العشري المماثل للمستخدم في تسمية الإنزيمات.
مثال للتسمية الحديثة:
10. Bromoviridae اسم العائلة ورقمها
10.0.1. Alfamovirus المجموعة الأولى ورقمها
10.0.1.0.001 Alfalfa mosaic virus الفيروس الممثل للمجموعة الأولى ورقمه (فيروس تبرقش البرسيم)
10.0.2. Ilarvirus المجموعة الثانية ورقمها
10.0.2.01. Ilarvirus Subgroup 1 تحت المجموعة الثانية ورقمها
10.0.2.01.01 Tobacco streak virus الفيروس الممثل لتحت المجموعة الثانية ورقمه (فيروس تخطيط التبغ)
10.0.2.02. Ilarvirus Subgroup 2
10.0.2.02.01 Asparagus virus 2
10.0.2.02.02 Blueberry necrotic shock virus
10.0.2.02.03 citrus leaf rugose virus
10.0.2.02.04 citrus variegation virus
10.0.2.02.05 Elm mottle virus
10.0.2.02.06 Tulare apple mosaic virus
10.0.2.03. Ilarvirus Subgroup 3
10.0.2.03.01 Apple mosaic virus
10.0.2.03.02 Prunus necrotic ringspot virus
11. Bunyaviridae
11.0.U.01. Bhanja virus Group
11.0.U.02. Kaisodi virus Group
11.0.U.03. Mapputta virus Group
11.0.U.04. Okola virus Group 11.0.U.05. Resistencia virus Group 11.0.U.06. Upolu virus Group 11.0.U.07. Yogue virus Group 11.0.1. Bunyavirus
11.0.5. Tospovirus
11.0.5.0.001 Tomato spotted wilt virus
11.0.5.0.002 Impatiens necrotic spot virus
11.0.5.DE.01 Peanut yellow spot virus
11.0.5.T.DE.1 Groundnut ringspot virus
U : Unassigned yet. لم يتم اعتماده من اللجنة
DE: Not recognised by ICTV yet, listed in database of VIDEdB.لم يتم إقراره من اللجنة و إنما تم وضعه في قائمة قواعد المعلومات الخاصة بالفيروسات النباتية.
T : Tentative مقترح (مؤقت)
بدأ تصنيف الفيروسات عامة بتقسيمها إلى مجاميع على أساس تركيبها وخصائصها.ونظراً لازدياد الفيروسات التي تم التعرف عليها فقد استخدم نظام جديد لتقسيمها.
Family (العائلة)
تم التمييز بين العوائل باستخدام خصائص قياسية لشكل الفيروسات وخصائص الحمض النووي. ويعتبر الشكل الخارجي لجسيمة الفيروس هو الصفة الأساسية للتقسيم إلى عوائل.
Genus (الجنس)
تعتبر خصائص الحمض النووي هي الصفة الأساسية للتمييز بين أجناس الفيروسات.
Species (النوع)
يعتبر النوع طبقة لها مجموعة من الخصائص العامة التي لا يمكن الاعتماد على إحداها فقط للتمييز بين الأنواع المختلفة ولها صفات سلالية مشتركة يصعب معها التمييز بين الفيروسات في مثل هذه المجموعات ويوجد في نوع محدد من البيئات الحيوية ويقصد بها العوائل والأنسجة التي يوجد ويتكاثر (يكرر) بها الفيروس؟؟؟
العوائل و المجاميع الفيروسية النباتية هي:
• Alfamoviruses: Bromoviridae
• Alphacryptoviruses: Partitiviridae
• Badnaviruses
• Betacryptoviruses: Partitiviridae
• Bigeminiviruses: Geminiviridae
• Bromoviruses: Bromoviridae
• Bymoviruses: Potyviridae
• Capilloviruses
• Carlaviruses
• Carmoviruses: Tombusviridae
• Caulimoviruses
• Closteroviruses
• Comoviruses: Comoviridae
• Cucumoviruses: Bromoviridae
• Cytorhabdoviruses: Rhabdoviridae
• Dianthoviruses
• Enamoviruses
• Fabaviruses: Comoviridae
• Fijiviruses: Reoviridae
• Furoviruses
• Hordeiviruses
• Hybrigeminiviruses: Geminiviridae
• Idaeoviruses
• Ilarviruses: Bromoviridae
• Ipomoviruses: Potyviridae
• Luteoviruses
• Machlomoviruses
• Macluraviruses
• Marafiviruses
• Monogeminiviruses: Geminiviridae
• Nanaviruses
• Necroviruses
• Nepoviruses: Comoviridae
• Nucleorhabdoviruses: Rhabdoviridae
• Oryzaviruses: Reoviridae
• Ourmiaviruses
• Phytoreoviruses: Reoviridae
• Potexviruses
• Potyviruses: Potyviridae
• Rymoviruses: Potyviridae
• Satellite RNAs
• Satelliviruses
• Sequiviruses: Sequiviridae
• Sobemoviruses
• Tenuiviruses
• Tobamoviruses
• Tobraviruses
• Tombusviruses: Tombusviridae
• Tospoviruses: Bunyaviridae
• Trichoviruses
• Tymoviruses
• Umbraviruses
• Unassigned potyviruses: Potyviridae
• Unassigned rhabdoviruses: Rhabdoviridae
• Varicosaviruses
• Waikaviruses: Sequiviridae
• Ungrouped viruses
53 plant viral genera 53 جنساً (مجموعة)
10 Families 10 عوائل